Юный компьютерный гений Джереми Белпойс (главный герой и псевдоним автора) с друзьями случайно обнаруживают на старом заводе заброшенную лабораторию, напичканную компьютерами. Покрытые слоем пыли машины открывают портал в цифровой мир Лиоко, в котором живет виртуальная девочка Аэлита.
Неожиданно Джереми узнает, что в Лиоко может попасть любой человек из реального мира. А значит, Аэлита тоже когда-то могла быть простой девочкой.
Но кто сделал ее виртуальной? И почему только она знает секретный код вируса X.A.N.A., способный уничтожить не только виртуальный, но и реальный мир Джереми.